CTCF binding, nucleosome positioning and 3D chromatin organization with Dr Christopher Clarkson

The Genomics Lab

Вміст надано Olivia Grant. Весь вміст подкастів, включаючи епізоди, графіку та описи подкастів, завантажується та надається безпосередньо компанією Olivia Grant або його партнером по платформі подкастів. Якщо ви вважаєте, що хтось використовує ваш захищений авторським правом твір без вашого дозволу, ви можете виконати процедуру, описану тут https://uk.player.fm/legal.

3y ago 1:07:32

M4A•Головна епізоду

In today's episode, we are excited to be talking to Dr Christopher Clarkson, currently based at UCL, where he has just started a post-doctoral research position.

In 2020, Dr. Clarkson completed his PhD at the University of Essex where he investigated changes of nucleosome positioning and 3D chromatin organization! In today's episode, we discuss how CTCF binding strength correlates with nucleosome repeat length and what the implications are of this on gene regulation. We further discuss how regions in the genome where CTCF is able to bind are extremely important for cellular differentiation and boundary formation within the genome.

Email: c.clarkson@ucl.ac.uk

Chris' Nucleic Acid Research article: CTCF-dependent chromatin boundaries formed by asymmetric nucleosome arrays with decreased linker length

Twitter: find Chris on twitter here.

Check out Biobox Analytics here, the ideal platform for working with NGS data, running and designing bioinformatic pipelines and generating the perfect plots: https://biobox.io/

34 епізодів

#Science #Biology #Olivia Grant and Eleanor Watson #Eleanor Watson #Olivia Grant